После кораблекрушения Джон Би, Сара, Джей-Джей, Киара, Поуп и Клео оказываются на необитаемом острове без денег, связи и понятного плана. Спасение возвращает их не к спокойной жизни, а в новую охоту за золотом Эльдорадо. Джон Би встречает отца, которого считал погибшим, и пытается заново выстроить с ним отношения. Тем временем друзья втягиваются в противостояние с опасным охотником за сокровищами, а Уорд снова вмешивается в судьбу Сары.

Джон Би и его отец ищут путь к легендарному золоту Эльдорадо
Сара пытается разобраться в чувствах к Джону Би и семье Камеронов
Джей-Джей и Киара сближаются, пока их преследуют новые опасности
Поуп и Клео расследуют тайну дневника и след древнего сокровища

Этот сезон заметно мрачнее и масштабнее прежних: вместо гонки за золотом королевского торговца герои отправляются в глубь Южной Америки, где им приходится разбираться с картами, дневниками и чужими ловушками. Приключение становится почти экспедиционным, но личные конфликты никуда не исчезают. Джон Би спорит с отцом, Сара сталкивается с последствиями решений семьи, а Джей-Джей, Киара, Поуп и Клео получают собственные опасные маршруты. Дружба компании проходит очередную проверку, пока охота за Эльдорадо превращается в борьбу нескольких групп.